Goku Jr. é o tataraneto de Son Goku, nascido no ano 880, quase 100 anos após a transformação de seu antepassado no legendário Super Saiya-jin 4, e criado por sua avó Pan.
Apesar das influências de sua avó Pan, que ainda vive impressionada pelas grandes aventuras e façanhas de seu avô, e que trata de transmitir seu legado, Goku Jr. é um menino normal, que vai ao colégio e passa seu tempo livre jogando a seu consola Playstation. Sempre escuta as histórias de sua avó, mas não toma demasiado interesse por , nem também não entende o significado do que eram as esferas de dragão e sua utilidade. Ademais, apesar de seu impressionante parecido físico com seu antepassado, não parece ter nenhuma das habilidades guerreiras de Goku, nem em atitude, nem em aptidão, já que no colégio se deixa avassalar por alguns de seus colegas. Não obstante, em ocasiões, quando se vê ameaçado tudo começa a tremer a seu arredor e seus olhos e cabelos brilham com intensidade por um instante, deixando claro que esconde algum tipo de potencial saiya-jin.
Sua verdadeira aventura começa quando Pan, já muito idosa, doente num dia do coração e a ingressam num hospital. Goku Jr., desesperado ante o diagnóstico dos médicos, que não parecem ter demasiadas esperanças, decide sair em busca da esfera de dragão, que sua avó lhe tinha contado que se encontrava no monte Paoz, na casa abandonada de Son Goku. Por conseguinte, começa seu travessia, acompanhado por Pack, um colega de colégio que opina que é demasiado perigoso para ele ir até ali só.
Superando vários perigos e bestas vão avançando, mas ao cruzar uma ponte, Pack cai ao vazio e Goku Jr. sente-se culpado uma vez mais de não ter sido o suficientemente valente e forte para defender a seu amigo. Pouco depois encontra-se com um pequeno urso ao que ajuda, e a mãe agradecida, decide lhe acompanhar e lhe proteger o resto do caminho. Mas não demoram muito em topar com um novo perigo...uma besta inteligente, que é realmente poderosa e ameaça com lhes matar a todos. Mamãe ouso ataca, mas não é rival para o monstro. O pequeno Goku Jr., dúvida durante alguns momentos, mas finalmente enfurece-se para valer e decide fazer frente ao monstro. Cheio de ira transforma-se em Super Saiya-jin e vence facilmente.
Por fim consegue chegar à casa de Son Goku, sua tataravó, e encontra a Suu Shin Chuu, a esfera de quatro estrelas, à que pede faz favor que cure a sua doente avó. Como não podia ser de outra maneira, não ocorre nada ao se tratar de uma sozinha Esfera de Dragão, mas de repente, aparece Son Goku, que lhe explica o verdadeiro funcionamento das esferas de dragão, e a importância do valor e a amizade na vida...por fim, o pequeno Goku Jr., crê e entende todas as histórias que lhe contava sua avó Pan, e decide olhar sempre para a frente. Son Goku desaparece e Goku Jr. fica desconcertado por um momento, ao não ter obtido uma solução para salvar a sua avó, mas nesse momento, tanto ela como Pack, chegam num avião, ambos recuperados e sorridentes. Goku Jr. sabe por fim como enfrentar seu destino e se enfrentar à vida.
Não muito tempo depois, Goku Jr., e Vegeta Jr., enfrentam-se na final de um indefinido Tenkaichi Budokai, novamente com o fantasma de Son Goku como espectador orgulhoso da nova geração.